Lấy bối cảnh Trái Đất chưa từng có siêu anh hùng hay quái thú, một người ngoài hành tinh bị mất trí nhớ, bất ngờ rơi xuống từ bầu trời. Anh lấy tên Sorato và bắt đầu khám phá thế giới loài người đầy cảm xúc lẫn mâu thuẫn. Khi những con quái thú khổng lồ lần đầu xuất hiện, Sorato vô thức nhớ lại sứ mệnh của mình và biến thân thành Ultraman Omega, sử dụng vũ khí đặc trưng Omega Slugger để chiến đấu bảo vệ Trái Đất.